Dans les faits, la Moscovie envoya plusieurs voivodes en Ukraine pour « libérer » le peuple du joug polonais et le soumettre à s propre autorité. Les voivodes moscovites refusèrent de se placer sous le commandement de l’Hetman et appliquèrent la politique d’unification décréter par Moscou : lever d’impots, transfert du patriarcat de Kyiv à Moscou, …. Les pouvoirs de Khmelnytsky furent considérablement réduit, celui-ci ne conservant que la direction de l’armée Cosaque. Les Zaporogues quant à eux conservaient une relative indépendance du fait de leur situation géographique.
 

par Mychailo Fartukh Petro DOROSHENKO

Le mécontenement générale qui résultat de la prise en main par les Moscovites, poussa Khmelnytsky à chercher des contacts à l’extérieur, notamment avec la Suède, pour se débarrasser de l’autocratie moscovites. Ne souhaitant pas rompre complètement avec la Moscovie, Khmelnytsky avait envisagé l’avenir de l’Hetmanat comme état neutre sous un protectorat commun de la Suède, la Moscovie et l’Empire Ottoman. Ne pouvant trouver de terrains d’entente avec ses partenaires potentiels, Khmelnytsky négocia uniquement avec les Suédois un accord sur le protectorat de l’Hetmant par la Suède. Ceci conduisit donc à un début de manœuvre en vue de se soustraire à la domination Moscovite, mais cela n’aboutit pas en raison du décès de Bohdan Khmelnytsky le 27 juillet 1657. Le successeur de Khmelnytsky, Ivan Vyhovsky tenta de poursuivre sa politique, mais la Suède, attaquée par le Danemark, interrompit sa campagne en Europe de l’Est. Vyhovsky n’eut d’autre choix que d’accepter le nouveau traité proposé par le Royaume de Pologne : Un état ukrainien, nommé « Grand Duché de Ruthénie », autonome au sein de la confédération Polono-Lituanienne. Il fut signé à Hadiatch en septembre 1658. Le Tsar ne l’entendit pas de cette oreille et dépêcha en Ukraine un forte armée. Celle-ci s’arrêta à Konotop, où elle fut écrasée en juin 1659 par les Cosaques de Vyhovsky, aidés de nombreux mercenaires et soutenues par les tatars. Malheureusement, l’Hetman ne fut pas soutenu par les Zaporogues de la Sich, qui voyaient d’un mauvais œil ce retour sous l’influence Polonaise. Il dut abdiquer peu après.

Débuta alors en Ukraine, dès 1660, une période appelée la Ruine, symbolisant la destruction lente de l’Hetmanat. L’Ukraine était de facto divisé en deux parties, soumise à l’ouest à l’influence polonaise, et à l’est, à l’influence moscovite. Chacune des parties élisaient son propre Hetman, au pouvoir considérablement réduit, mais s’attachant à rentrer dans les bonne grâces de son suzerain respectif. Petro Doroshenko, élu Hetman de la Rive Droite en 1665, tenta de reprendre la politique de Khmelnytsky, et chercha à s’allier avec l’Empire Ottoman, afin de reconstituer un Etat Ukrainien indépendant. Soutenu par une forte armée tatar, il battit les polonais en 1666. Malheureusement pour lui, la Pologne et la Moscovie décidèrent de signer la paix, en s’accordant, par le traité d’Androusovo le partage de l’Ukraine en rive droite et rive gauche. Aidé de l’Empire Ottoman, qui déclara la guerre à la Pologne en 1671, il parvint à reconquérir l’Ukraine de la rive droite, à la suite de sa victoire à Kamianetz, à la suite duquel fut signé le traité de Bouchach, en septembre 1672. Mais Doroshenko eu beau s’évertuer à reconstituer l’Hetmanat indépendant, il ne trouva pas de soutient à la Sich Zaporogogue, dont l’Hetman, Ivan Sirko, persistait à se battre contre l’infidèle, le Tatar de Crimée, alors allié de Doroshenko. Ces guerres de pouvoirs internes aux Cosaques Ukrainiens détruisit pour un certain nombre d’année l’espoir de la reconstruction d’un Etat Indépendant, et permit à la Moscovie d’asseoir progressivement son pouvoir sur l’Ukraine de la Rive Gauche.